Najczęstszą przyczyną ostrej biegunki są zakażenia bakteryjne, wirusowe lub pasożytnicze przewodu pokarmowego. Patogeny oraz produkowane przez nie toksyny uszkadzając komórki nabłonkowe jelit, zaburzają procesy wchłaniania i przyczyniają się do powstania biegunki. Zdarza się również, że przyczyną biegunki jest alergia pokarmowa lub spożycie substancji działających toksycznie na organizm (niejadalnych, trujących grzybów, alkoholu etylowego, itp.).
Przewlekła biegunka, trwająca ponad 10 dni może być wynikiem:
* błędów dietetycznych, nietolerancji laktozy, celiakii (tzw. biegunka osmotyczna, na skutek uszkodzenia komórek jelit),
* stosowania leków (antybiotyków o szerokim zakresie działania, leków obniżających ciśnienie krwi, leków przeciwarytmicznych, cytostatycznych),
* przewlekłej choroby jelit ,
* zaburzeń w trawieniu i przyswajaniu tłuszczów.
Ze względu na znaczną utratę płynów ustrojowych i ryzyko odwodnienia organizmu, leczenie biegunki należy rozpocząć jak najwcześniej, stosując środki nawadniające oraz przeciwbiegunkowe, a w razie braku poprawy - konieczna może okazać się wizyta u lekarza.